洁净室是通过采取密闭的结构，合理的空气处理方法，合理的气流组织及合理的压差，才能使其微环境达到所要求的空气洁净度，来满足生产要求。所以说，空气洁净技术也称洁净室技术。控制空气洁净的办法一种是送入洁净空气对室内污染空气进行稀释，另外一种是加速排出室内浓度高的污染空气。为保证生产环境或其他用途的洁净室所要求的空气洁净度，需要采取多方面的综合措施才能达到目标。这些综合措施包括以下几个方面。
一、控制污染源，减少污染发生量
尽量采用产生污染物质少的工艺及设备，或采取必要的隔离和负压措施，防止生产工艺产生的污染物向周围扩散；减少人员及物料带入室内的污染物质。
二、有效地阻止室外的污染侵入室内
这是洁净室污染控制的最主要途径，要考虑空气洁净处理的方法、室内的压力控制等。根据房间不同的洁净度要求，用不同方式送入经过不同处理的、数量不等的清洁空气，同时排走室内产生的所有脏空气，使室内空气维持在要求的洁净度水平。由此可见，对送入空气的洁净处理是十分关键的环节，这也是洁净室换气次数大大超过一般空调房间的原因。洁净度等级越小，其换气次数越多，对于室内正压的控制，工业洁净室和一般生物洁净室采用正压措施。
三、迅速有效地排除室内已经发生的污染
这也是体现洁净室功能的关键。合理的气流组织，即通过送风口及回风口位置、大小、形式的精心设计，使室内气体沿一定方向流动，以防止死角及造成二次污染。不同的气流组织均直接影响施工的难度及工程造价。
四、流速控制
洁净室内空气的流动既要有一定速度，才能防止其他因素（如热流）的扰乱，但又不能太大，流速太大将使室内积尘飞扬，造成污染。
五、系统的气密性
不仅通风系统本身要求气密性好，对建筑各部分结合处、水暖电工艺管道穿越围护结构处亦应堵严，防止渗漏。一般看得见的缝隙、裂缝均无法阻止0.5um粒径的粉尘通过。
六、建筑上的措施
涉及建筑周围环境的设计、建筑构造、材料选择、平面布局、气密性措施等。可采用产尘率少、不易滋生微生物的室内装修材料和家居。在生产工艺或操作过程中，利用空气洁净技术来控制生产车间的微粒污染，就必须采用符合要求的材料来建造洁净室。只有在洁净室+内，才能有效地控制微粒污染。可见，空气洁净技术与洁净室密不可分。